中國熱科院發布西(xī)番蓮染色體級别精細基因組

　　近日，中國熱科院海口實驗站(zhàn)西(xī)番蓮育種高(gāo)效栽培研究團隊在西(xī)番蓮染色體級别基因組解析和風味物(wù)質合成機理研究方面取得重要進展。

　　研究團隊利用Illumina、Nanopore、Hi-C測序，采用NextDenovo + SMARTdenovo + NextPolish策略組裝，獲得~1341.7 Mb的基因組，經與其它19種近緣植物(wù)基因家族比較分析，發現西(xī)番蓮與大戟科（蓖麻，橡膠樹和木(mù)薯）親緣關系最密切，發布西(xī)番蓮染色體級别基因組，明确百香果的進化地位；此外，從基因組、轉錄組和代謝組等多(duō)組學角度挖掘了影響西(xī)番蓮風味的潛在基因和基因家族，明确α-亞麻酸代謝、代謝途徑和次生(shēng)代謝途徑是參與西(xī)番蓮風味形成過程中重要揮發性有機物(wù)（VOCs）合成的主要途徑，爲西(xī)番蓮的改良栽培提供寶貴的資源。

　　該項工(gōng)作相(xiàng)關研究結果，以題爲：“Chromosome-scale genome assembly provides insights into the evolution and flavor synthesis of passion fruit （Passiflora edulis Sims） ”在中科院JCR一(yī)區的TOP期刊《Horticulture Research》發表。中國熱科院海口實驗站(zhàn)黃東梅助理研究員、海南(nán)大學夏志(zhì)強副教授、齊魯工(gōng)業大學張聖奎博士爲共同第一(yī)作者，中國熱科院海口實驗站(zhàn)宋順副研究員、詹儒林研究員爲通(tōng)訊作者。該項工(gōng)作得到(dào)了中國熱帶農業科學院專項資金支持。